Vědecko-výzkumné pracoviště Lázní Mšené bylo zřízeno k 1. únoru 2008 s cílem věnovat náležitou péči objektivizaci léčebných procesů a využít aktuálních vědeckých poznatků v medicíně a lázeňství. Ročně věnují lázně na vědu a výzkum kolem 500 tis. Kč s perspektivou dalšího navyšování.
Založení tohoto pracoviště předcházela dvouletá činnost Vědeckovýzkumné rady lázní jejímiž aktivními členy se stali přední vědečtí pracovníci Ústavu informatiky ČAV a Euromise, vedoucí lékaři lázní, přední specialisté medicínské a fyzioterapeutické praxe. 22. února 2006 byla mezi Evropským centrem pro medicínskou informatiku, statistiku a epidemiologii (dále EuroMISE centrum) zastoupeným Ústavem informatiky AV ČR v osobách Prof. RNDr. Jana Zvárová, DrSc. a Prof. RNDr. Jiří Widermann, DrSc. a Lázněmi Mšené a. s. zastoupenými Bc. Františkem Ochem a MUDr. Janem Medonosem podepsána rámcová smlouva o spolupráci ve výzkumu, vzdělávání a dalších společensky prospěšných aktivitách v mezioborové oblasti medicínské informatiky a statistiky, zejména v souvislosti s problematikou rozvoje informační společnosti ve zdravotnictví a aplikacích eZdraví.
Hlavním cílem vědeckovýzkumného pracoviště je zdokonalovat lázeňské rehabilitační procesy s využitím nejmodernějších fyzioterapeutických postupů spolu s aplikací vynikajícího léčivého peloidu („bahna“) tak, aby volba léčebných postupů byla co nejvíce objektivizována poznaným účinkem fyzioterapie v kombinací s balneoterapií. Jinými slovy, aby pacient i lékaři a ekonomové zdravotních pojišťoven byli co nejvíce spokojeni s pozitivním výsledkem léčení a také s léčebnými náklady. Mšensko-lázeňský peloid má vynikající chemické složení a je odebírán v omezeném množství z tradičního ložiska, které se nalézá ve státní přírodní rezervaci Vrbka v těsné blízkosti Mšeného-lázní. Zároveň se připravuje obnovení tradičních lázeňských pramenů SALVE a Ferdinandův, na kterých vlastně lázně před více než 200 roky vznikly.
Od roku 2006 do roku 2007 byly řešeny dva pilotní výzkumné úkoly zabývající se vlivem lázeňské léčby na stavy pacientů s diagnózami „arthroza kyčelního kloubu“ a „bolesti zad“. Vyhodnocující analýzy vyplývající z těchto výzkumných úkolů ukazují na statisticky významné pozitivní ovlivnění stavu pacientů s uvedenými diagnozami. Vzhledem k povzbuzujícím a využitelným výsledkům řešení úkolů, jakož i k rozvíjející se spolupráci Lázní Mšené s EuroMISE centrum i dalšími významnými externími institucemi a osobnostmi, doporučila Vědecko-výzkumná rada (VVR) vedení Lázní, aby uvážilo možnosti pokračovat ve výzkumných aktivitách a spolupráci formou oficiální spoluúčasti na národním i mezinárodním výzkumu. VVR se shodla na záměru, aby byly pro rok 2008 a 2009 připraveny a rozpracovány návrhy spoluúčasti Lázní na řešení národních i mezinárodních grantů. VVR doporučila, aby hlavním řešitelem grantů bylo EuroMISE centrum, s jehož vedením by byly záměry projednány, navrženy a koordinovány. Jde o návrhy jak na národní, tak na užší i širší mezinárodní úrovni. K řešením mohou Lázně přispět jak svými kapacitami, tak jmenovitými výzkumnými výsledky a zkušenostmi. Návrhy jsou propojeny na plány vědeckovýzkumné činnosti Lázní pro rok 2009 a úkoly tak budou řešeny i za předpokladu, že do některých grantů bude možno vstoupit až v příštím roce. Navrhovaný výzkum bude mít převážně povahu intervenčních klinických studií, ve kterých budou pacienti s jejich souhlasem přijímáni s konkrétní diagnózou onemocnění pohybových ústrojí. Pacientům bude poskytována standardní lázeňská léčba, přičemž budou ještě na základě randomizačního seznamu přiřazeni na některou fyzioterapeutickou proceduru, kterou může být některá klasická analytickou rehabilitační metoda, resp. nové právě zaváděné metody. Ověřovanou medicínskou hypotézou je předpokládaná lepší účinnost nově navrhovaného fyzioterapeutického režimu spojeného s aplikací vynikajícího rašelinného peloidu při léčbě onemocnění pohybového ústrojí.

